文學院

• 中文系暨研究所
• 外文系暨研究所
• 日文系暨研究所
• 歷史系暨研究所
• 哲學系暨研究所
• 華語文教學國際碩士學位學程
• 英語中心

理學院

• 應物系暨研究所
• 化學系暨研究所
• 生科系暨研究所
• 應數系暨研究所
• 生醫暨材料科學國際博士學位學程
• 生物多樣性國際研究生博士學位學程

工學院

• 化材系暨研究所
• 環工系暨研究所
• 資工系暨研究所
• 工工系暨研究所
• 高階醫管碩專班EMHA（工工系）
• 電機系暨研究所
• 數位創新碩士學位學程

管理學院

• 企管系暨研究所
• 國貿系暨研究所
• 會計系暨研究所
• 統計系暨研究所
• 財金系暨研究所
• 資管系暨研究所
• 高階經營管理碩士在職專班（EMBA）
• 國際企業管理碩士學位學程(Global MBA)

社會科學院

• 經濟系暨研究所
• 政治系暨研究所
• 社會系暨研究所
• 社工系暨研究所
• 行政系暨研究所
• 公共事務碩士專班
• 教研所
• 師培中心
• 都研中心
• 東亞社會經濟研究中心

農學院

• 畜產系暨研究所
• 食科系暨研究所
• 餐旅系暨研究所
• 運動休閒與健康管理學位學程
• 高齡健康與運動科學學位學程
• 生物技術學程
• 實驗動物照護及使用委員會
• 農業推廣中心
• 實習農牧場

創意設計暨藝術學院

• 美術系暨研究所
• 景觀系暨研究所
• 工設系暨研究所
• 音樂系暨研究所
• 建築系暨研究所
• 表演藝術與創作碩士學位學程
• 建築研究中心

法律學院

• 法律系暨研究所
• 法律學院研究中心

國際學院

• 國際經營管理學位學程
• 永續科學與工程學士學位學程
• 國際學院不分系英語學士班

軍訓室

體育室

共同學科暨通識教育中心

研究單位

• 生命科學研究中心
• 智慧永續循環經濟研究中心
• 軟體工程與技術中心
• 兩岸社會經濟與管理研究中心
• 生態與環境研究中心

研究發展處

• 產學與育成中心
• 共同貴重儀器中心
• 國際職場實習發展中心

東海大學附屬學校

• 東海大學附屬實驗高級中學
• 東海大學附屬國民小學
• 東海大學附屬國民小學幼稚園